本学科现有安徽省农村水环境治理与水资源利用工程实验室（依托单位）、工业废水及环境治理安徽省重点实验室（共建单位）等多个省级科研平台。近些年，市政工程系教师共承担科研课题100多项，科研经费达2000万元以上，其中国家重点研发专项、水专项课题及子课题5项、国家自然科学基金项目10余项，省重大、省攻关及省自然科学基金项目8项，发表高水平论文近200篇。

        本学科主要研究方向：

(1)污水处理新技术开发与产业化研究，水和污水深度处理技术，废水生物燃料电池等资源化研究；

(2)畜禽养殖废弃物中微量污染物的迁移和转化；

(3)污水污泥和废弃物生产生物质能源，植物修复污染水生态；

(4)河流水环境及水质模拟、给排水工程中的水利优化模拟与分析；

(5)城市给排水工程规划与运行管理，输配水系统优化设计；

(6)建筑与小区雨水及中水利用，给水工程经济运行，水资源规划与利用。